অন্যান্য সমস্ত দেবতার মতো, ভগবান গণেশও অসুর শক্তিকে ধ্বংস করার জন্য বিভিন্ন অবতার গ্রহণ করেছিলেন। গণেশ পুরাণ, মুদ্গল পুরাণ, গণেশ অঙ্ক ইত্যাদি গ্রন্থে গণেশের এই অবতারের বর্ণনা পাওয়া যায় । ভগবান গণেশের সেই সমস্ত অবতারের কিছু কাহিনী এখানে তুলে ধরা হল :-
বক্রতুন্ডা :
মৎসরাসুর রাক্ষসকে দমন করার জন্য বক্রতুন্ড রূপ ধারণ করেছিলে ভগবান গনেশ । মৎসরাসুর ভগবান শিবের ভক্ত ছিলেন এবং শিবের উপাসনা করে তিনি বর পেয়েছিলেন যে তিনি অকুতোভয় হবেন । দেবগুরু শুক্রাচার্যের নির্দেশে মৎসরাসুর দেবতাদের অত্যাচার শুরু করেন। তারও দুটি পুত্র ছিল, সুন্দরপ্রিয়া এবং বিষয়প্রিয়া, দুজনেই খুব নিষ্ঠুর ছিল। সমস্ত দেবতা শিবের শরণাপন্ন হলেন। শিব তাদের আশ্বস্ত করেছিলেন যে তারা গণেশকে ডাকলে, গণপতি বক্রতুন্ডা অবতার নিয়ে আসবেন। দেবতারা পূজা করলেন এবং গণপতি বক্রতুন্ডা অবতার গ্রহন করলেন। ভগবান বক্রতুন্ড মৎসরাসুরের উভয় পুত্রকে হত্যা করেন এবং মৎসরাসুরকেও পরাজিত করেন। একই মতরাসুর পরে গণপতির ভক্ত হন।
একদন্ত :
মহর্ষি চ্যবন তাঁর আধ্যাত্মিক শক্তি দিয়ে মাদকে সৃষ্টি করেছিলেন। তাকে চ্যবনের পুত্র বলা হয়। মাদ রাক্ষসদের গুরু শুক্রাচার্যের কাছে দীক্ষা নেন। শুক্রাচার্য তাঁকে সর্বপ্রকার জ্ঞানে পারদর্শী করেছিলেন। শিক্ষা লাভের পর তিনি দেবতাদের বিরোধিতা করতে থাকেন। সমস্ত দেবতারা তার দ্বারা হয়রান হতে লাগলেন। মদ এতটাই শক্তিশালী হয়েছিলেন যে তিনি শিবকেও পরাজিত করেছিলেন। সব দেবতা মিলে গণপতির পূজা করলেন। তারপর ভগবান গণেশ এক দন্তযুক্ত রূপে আবির্ভূত হলেন। তার ছিল চারটি বাহু, একটি দাঁত, একটি বড় পেট এবং তার মাথা ছিল হাতির মতো। তার হাতে ছিল একটি ফাঁস, একটি কুঠার এবং একটি প্রস্ফুটিত পদ্ম ছিল। একদন্ত দেবতাদের নির্ভীকতা প্রদান করেন এবং যুদ্ধে মদাসুরকে পরাজিত করেন।
মহোদর :
কার্তিকেয় যখন তারাকাসুরকে বধ করেন, তখন দানব গুরু শুক্রাচার্য মহাসুর নামে এক অসুর সৃষ্টি করে তাকে দেবতাদের বিরুদ্ধে উত্থাপন করেন। মহাসুর থেকে মুক্তি পাওয়ার জন্য দেবতারা গণেশের পূজা করেছিলেন। তখন গণেশ মহোদর অবতার গ্রহণ করেন। মহোদার পেট অনেক বড় ছিল। ইঁদুরের পিঠে চড়ে তিনি যখন মহাসুরের শহরে পৌঁছলেন, তখন যুদ্ধ না করেই মহাসুর গণপতিকে নিজের আরাধ্য হিসাবে স্বীকার করেন ।
গজানন:
একবার ধনরাজ কুবের শিব ও পার্বতীর দর্শন নিতে কৈলাস পর্বতে পৌঁছেছিলেন । সেখানে পার্বতীকে দেখে কুবেরের মন কামার্ত হয়ে ওঠে। সেই কারণে লোভাসুরের জন্ম হয়। তিনি শুক্রাচার্যের কাছে যান এবং শুক্রাচার্যের আদেশে শিবের পূজা শুরু করেন। শিব লোভাসুরের প্রতি সন্তুষ্ট হলেন । তিনি তাকে নির্ভীক হওয়ার বর দিয়েছেন। এর পর লোভাসুর সমস্ত জগৎ দখল করে নেন এবং স্বয়ং শিবকে তার জন্য কৈলাস ত্যাগ করতে হয়। তারপর দেবগুরু সমস্ত দেবতাকে গণেশের পূজা করার উপদেশ দিলেন। গণেশ গজাননের রূপে আবির্ভূত হয়ে দেবতাদের বর দেন যে তিনি লোভাসুরকে পরাজিত করবেন। গণেশ লভাসুরকে যুদ্ধের বার্তা পাঠালেন । শুক্রাচার্যের পরামর্শে লভাসুর যুদ্ধ না করেই পরাজয় মেনে নেন।
বিঘ্নরাজা :
একবার পার্বতী তার বন্ধুদের সাথে কথা বলার সময় উচ্চস্বরে হেসেছিল। তার হাসি থেকে এক বিশাল মানুষের জন্ম হয়। পার্বতী তার নাম রাখেন মম (মমতা)। মা পার্বতীর সাথে দেখা করে তিনি তপস্যার জন্য বনে যান। সেখানে তিনি শম্বরাসুরের সঙ্গে দেখা করেন। শম্বরাসুর তাকে অনেক দৈত্য শক্তি শিখিয়েছিলেন। তিনি মমকে গণেশ পূজা করতে বললেন। মম গণপতিকে প্রসন্ন করে ব্রহ্মাণ্ডের রহস্য জানতে চাইলেন।
শম্বর তাকে তার কন্যা মোহিনীর সাথে বিয়ে দেন। শুক্রাচার্য মায়ের তপস্যার কথা শুনে তাঁকে দৈত্যরাজ পদে সম্মানিত করেন । মামাসুরও অত্যাচার শুরু করে এবং সকল দেবতাকে বন্দী করে কারাগারে বন্দী করে। তারপর দেবতারা গণেশের পূজা করলেন। গণেশ বিঘ্নরাজ রূপে অবতীর্ণ হন । তিনি মামাসুরকে অপমান করে দেবতাদের মুক্তি দেন।
লম্বোদর : জলন্ধরকে বধ করার জন্য ভগবান বিষ্ণু তাঁর স্ত্রী বৃন্দার সতীত্ব নষ্ট করেছিলেন । তার থেকে এক অসুরের জন্ম হয়, তার নাম ছিল কামাসুর। শিবের আরাধনা করে কামাসুর তিন জগত জয়ের বর পেয়েছিলেন । এরপর তিনি অন্যান্য অসুরদের মতো দেবতাদের অত্যাচার করতে থাকেন। তারপর সমস্ত দেবতারা গণেশের ধ্যান করলেন । তখন ভগবান গণপতি এক ভয়ঙ্কর রূপে অবতীর্ণ হন। ভগবান ময়ূরের উপর বসে এক ভয়ঙ্কর রূপে আবির্ভূত হলেন। তিনি দেবতাদের নির্ভীকতা প্রদান করে কামাসুরকে পরাজিত করেন।
ধূম্রবর্ণ :
একবার ভগবান ব্রহ্মা সূর্যদেবকে কর্ম রাজ্যের অধিপতি নিযুক্ত করেছিলেন। রাজা হওয়ার সাথে সাথে সূর্য গর্বিত হয়ে উঠলেন। তিনি একবার হাঁচি দেন এবং সেই হাঁচি থেকে একটি অসুরের জন্ম হয়। তার নাম ছিল আহাম। তিনি শুক্রাচার্যের কাছে গিয়ে তাঁকে নিজের গুরু করেন। তিনি অহংকার থেকে অহন্তাসুর হয়েছিলেন। তিনি নিজের একটি রাজ্য প্রতিষ্ঠা করেছিলেন এবং তপস্যায় ভগবান গণেশকে খুশি করে বর পেয়েছিলেন। তিনি অনেক অত্যাচার ও অনাচার করেছিলেন। তখন গণেশ ধূম্র বর্ণ রূপ ধারণ করে অবতীর্ণ হন । তার গায়ের রং ধোঁয়ার মতো এবং বিকট রূপ । তার হাতে একটি প্রচণ্ড পাশা ছিল যা থেকে প্রচুর অগ্নিশিখা বেরিয়েছিল। ধূম্রবর্ণ অহন্তাসুরকে পরাজিত করেন। তাকে যুদ্ধে পরাজিত করে তার ভক্তি দান করেন ।।